服務介紹
RNA合成是指在體外通過化學合成方法合成RNA分子的過程,通常采用無機化學方法合成磷酸二酯鍵,將核苷酸逐個連接成RNA鏈。RNA合成是一項重要的生物技術手段,可以用于研究RNA分子的結構、功能、調控機制等方面。合成的RNA分子可以用于體外轉錄、RNA交互、RNA穩定性研究、RNA純化等方面的研究。RNA合成技術已經發展成為一種高效、快速的合成RNA的方法,為RNA生物學和基因工程研究提供了有力支持。
金開瑞RNA合成服務內容包括:單鏈RNA合成、雙鏈RNA合成、RNA修飾及標記、siRNA、miRNA mimics合成等。為保證RNA oligo高質量,合成RNA均經MALDI-TOF質譜鑒定 (matrix-assisted laser desorption ionization-time-offlight),并嚴格執行QC標準,并通過HPLC對產物RNA進行純度分析,保證最終發到客戶手中的RNA質量。
服務優勢
- 靈活多樣的合成規格: 1OD、 2OD、 4OD …… , 可大批量定制;
- 20多年豐富經驗的引物合成專家團隊;
- 高質量: ISO 9001 認證,全面的質控報告 (HPLC/MS/CGE);
- 具有競爭力的價格。
服務流程
客戶提供
RNA序列或者需要設計的基因名稱和基因序列及要求。
最終交付
- 合成的RNA凍干粉;
- COA文件;
- 檢測報告 (MS/HPLC/CGE) (客戶可根據實驗需要選擇檢測方式,需另行收費)。
服務說明
產品名稱 | 合成量(OD) |
普通siRNA oligos | 2 |
4 | |
5 | |
>5 | |
普通siRNA 三保一套餐 | 2 |
普通siRNA 四保一套餐 | 2 |
miRNA mimics 雙鏈 | 2 |
miRNA mimics NC | 2 |
miRNA inhibitors | 2 |
單鏈RNA(<70nt) | 2 |
>2 | |
通用陰性對照siRNA | 1 |
FAM標記通用陰性對照siRNA | 1 |
陽性siRNA,GAPDH | 1 |
標記RNA oligos | 2 |
4 |
常見問題與解析 (Q&A)
干燥制品如能存放于-80℃是最理想的,如不能請于-20℃保存,保存2年沒問題。 溶液狀態的RNA最好保存在-80℃,如無條件,請保存于-20℃。
干燥制品如能存放于-80℃是最理想的,如不能請于-20℃保存,保存2年沒問題。 溶液狀態的RNA最好保存在-80℃,如無條件,請保存于-20℃。
通常ChIP過程產生3份DNA產物,Input、IgG產物、IP產物。Input是染色質片段化后提取獲得的總DNA、未經抗體加入免疫沉淀過程,IgG組這是用實驗抗體的同型陰性對照抗體、作為mock IP,IP產物即是以實驗抗體獲得的免疫沉淀產物。 在后續的qPCR檢測中,通常將IgG產物組作為IP產物組的對照。如需設置陽性對照抗體,可以選擇Histone H3或者RNA polymerase II,然后以GAPDH或Actin等作為檢測基因。 在后續的Sequence中,通常將Input組產物作為測序對照樣品。
取材后新鮮組織須于-80℃保存,干冰運輸。動物組織>100mg,細胞數>106,植物組織>0.5g、幼嫩組織為宜,避免反復凍融。當檢測基因數較多時樣品質量須隨之增加。
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1、RNA合成方法
①化學合成法:
● 化學合成法是通過將核苷酸單元逐個連接起來合成RNA的方法。這種方法通常使用有機合成化學方法,如固相合成或液相合成。
● 在固相合成中,RNA鏈是在具有固定的核苷酸單元的合成支持上逐步構建的。每個核苷酸單元都具有保護基團,防止不需要的反應發生。核苷酸單元的添加通過去保護和活化步驟完成。
● 在液相合成中,核苷酸單元通過液相反應逐漸連接起來。這種方法通常用于較短的RNA片段的合成。
②體外轉錄法:
● 體外轉錄法利用體外轉錄系統合成RNA。這種方法通常使用DNA模板和RNA聚合酶來合成RNA。
● 在體外轉錄中,DNA模板需要包含適當的啟動子序列,以使RNA聚合酶能夠識別和啟動轉錄。通過加入核苷酸三磷酸(NTPs)和其他必要的輔助物質,體外轉錄系統可以合成RNA。
● 體外轉錄法可以使用細胞提取物或重組的RNA聚合酶進行。
③基于RNA酶的合成法:
● 基于RNA酶的合成法利用RNA酶的催化活性合成RNA。這種方法通常使用類似于體外轉錄的原理,但使用RNA酶代替RNA聚合酶。
● RNA酶可以選擇性地切割或連接RNA鏈的特定位置,從而合成特定的RNA序列。
2、在RNA合成中需要特別注意的點
● 模板設計和優化:選擇合適的DNA模板是體外轉錄或化學合成的關鍵。確保模板具有適當的啟動子序列、適當的長度和正確的目標序列。
● 高質量的起始材料:使用高質量的核苷酸單體、試劑和酶是確保合成RNA的成功的重要因素。確保使用新鮮、純凈和高質量的材料,避免使用過期或受污染的試劑。
● 脫保護步驟:對于化學合成方法,合成的RNA鏈通常會在核苷酸單元上有保護基團。脫除這些保護基團是合成成功的關鍵步驟,通常需要嚴格控制反應條件和使用適當的脫保護試劑。
● RNA純化和質量控制:合成的RNA可能會包含未反應的試劑、副產物或其他污染物。因此,在合成完成后,需要進行適當的純化步驟來去除這些雜質。此外,通過凝膠電泳、質譜分析等方法對RNA進行質量檢查和驗證,以確保所得到的RNA是純凈且具有所需的序列。
● RNA的穩定性:由于RNA易于降解,合成的RNA需要儲存在適當的條件下,如低溫和干燥環境中。使用RNase抑制劑和適當的儲存緩沖液可以增加RNA的穩定性。
● 注意反應條件:在體外轉錄或化學合成過程中,確保適當的反應溫度、時間和緩沖條件。反應條件的優化可能需要針對特定的RNA序列和合成方法進行調整。
● 防止RNA降解:在RNA合成和處理過程中,需要小心避免RNA受到RNase的污染。使用RNase-free的試劑和實驗器材,并在操作過程中采取嚴格的無菌技術,以防止RNA的降解。
3、不同類型RNA的應用
RNA類型 |
概念 |
應用 |
普通RNA | 在細胞中參與蛋白質合成的傳遞遺傳信息的RNA分子。 |
- 基因表達研究:作為mRNA分子,在細胞中被翻譯為蛋白質。 |
- 基因功能分析:通過干擾或增強RNA表達,研究基因在生理過程中的作用。 |
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siRNA | 小干擾RNA,長度約為20-25個核苷酸,可通過RNA干擾技術靶向抑制基因表達。 |
- 基因沉默:通過結合RISC復合體,靶向降解特定mRNA,抑制基因表達。 |
- 腫瘤治療:設計特異性siRNA靶向抑制腫瘤相關基因,達到治療腫瘤的目的。 |
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miRNA | 微小非編碼RNA,調控基因表達的調節子,長度約為20-25個核苷酸。 |
- 抗病毒研究:抑制病毒復制和感染,研究抗病毒機制和開發抗病毒治療方法。 |
- 基因表達調控:與mRNA互作,通過誘導降解或抑制翻譯調控基因表達。 |
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- 發育調控:參與胚胎發育、細胞分化以及生物體的生長和發育過程。 |
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修飾RNA | 經過化學修飾的RNA分子,具有增強穩定性或改變功能的特性。 |
- 疾病研究:研究miRNA與疾病發生、進展以及治療潛力之間的關聯 |
- 抗病毒研究:改變RNA分子的結構和穩定性,用于抗病毒藥物的研發。 |
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- RNA疫苗:修飾RNA作為疫苗載體,用于激發免疫反應以預防疾病 |
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sgRNA | 單導RNA,用于CRISPR-Cas9基因編輯技術中的靶向DNA序列的引導RNA。 |
- 基因編輯:與Cas9蛋白結合,引導Cas9蛋白靶向特定DNA序列 |
ASO | 寡核苷酸序列,具有特定序列和結構,用于靶向調控RNA的表達或功能。 |
- 基因沉默:通過與RNA靶點結合,抑制或調控特定RNA的表達。 |
- 遺傳疾病治療:針對某些遺傳性疾病中的突變基因進行精準調控和治療。 |
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- RNA穩定性調控:通過結合RNA分子,增強或降低其穩定性來調節RNA功能。 |