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高效、精準(zhǔn)、直觀、實時——取經(jīng)“蛋白互作研究翹楚”BIFC!

信息來源:金開瑞 作者:genecreate 發(fā)布時間:2024-05-14 13:37:42

    雙分子熒光互補(BimolecularFluorescent Complimentary, BiFC)技術(shù)是指通過具有相互作用親和力的兩個蛋白質(zhì),將分別與其相連的熒光蛋白片段拉近,組裝成完整的熒光蛋白,從而表征蛋白質(zhì)相互作用的發(fā)生及其空間位置。

    當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)A與蛋白質(zhì)B在細(xì)胞內(nèi)發(fā)生相互作用時,它們各自的熒光蛋白片段也會隨之靠近,形成完整的熒光蛋白構(gòu)象。這種構(gòu)象恢復(fù)使得熒光蛋白能夠發(fā)出特征熒光,從而在顯微鏡下可視化地反映出蛋白質(zhì)A與B的相互作用。

雙分子熒光互補驗證蛋白互作的原理圖

BIFC實驗流程

    ● 構(gòu)建融合蛋白:設(shè)計并合成針對目標(biāo)蛋白A和B的特異性引物,將其分別與熒光蛋白N端和C端片段基因融合,構(gòu)建相應(yīng)的表達(dá)載體。

    ● 細(xì)胞轉(zhuǎn)染:將含有融合蛋白A-N端和B-C端片段的載體同時或分別轉(zhuǎn)入感興趣的細(xì)胞系,實現(xiàn)融合蛋白的共表達(dá)。

    ● 熒光觀察:轉(zhuǎn)染后一段時間(通常24-48小時),使用熒光顯微鏡或共聚焦顯微鏡觀察細(xì)胞,若觀察到綠色(或?qū)?yīng)熒光蛋白顏色)熒光信號,說明蛋白質(zhì)A和B發(fā)生了相互作用。

BIFC技術(shù)優(yōu)勢

    ● 活細(xì)胞內(nèi)檢測:能夠在細(xì)胞生理狀態(tài)下直接觀察蛋白質(zhì)相互作用,保留了時空動態(tài)信息。

    ● 高特異性:只有當(dāng)目標(biāo)蛋白相互作用時,熒光信號才會出現(xiàn),減少了假陽性結(jié)果,提高了檢測的特異性。

    ● 多色標(biāo)記:通過使用不同顏色的熒光蛋白對,可同時檢測多個蛋白質(zhì)相互作用,實現(xiàn)多維度、多層次的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)研究。

    ● 直觀且定量:通過熒光強度衡量互作程度,可以通過熒光強度定量分析軟件進(jìn)行半定量或定量評估,為研究蛋白質(zhì)互作的動態(tài)變化和強度提供直觀且量化的數(shù)據(jù)。

    ● 適用于多種生物體系:廣泛適用于動物、植物、微生物等生物體系,在植物研究中,尤其適用于研究蛋白質(zhì)在特定細(xì)胞器、細(xì)胞結(jié)構(gòu)或特定生理條件下的互作。

    ● 檢測弱或瞬時相互作用:對低親和力、短暫相互作用敏感,能夠揭示一些傳統(tǒng)方法難以檢測到的相互作用。

BIFC技術(shù)應(yīng)用

    ● 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)研究:揭示復(fù)雜信號通路中蛋白質(zhì)間的直接相互作用。

    ● 細(xì)胞內(nèi)定位與動態(tài)研究:觀察蛋白質(zhì)相互作用在細(xì)胞內(nèi)的空間分布及其隨時間的變化。

    ● 藥物篩選與驗證:檢測候選藥物對特定蛋白質(zhì)相互作用的影響,評估其生物活性。

    ● 植物科學(xué):研究植物生長發(fā)育、逆境響應(yīng)、信號傳遞等過程中的關(guān)鍵蛋白質(zhì)互作。

    ● 神經(jīng)科學(xué):揭示神經(jīng)元間或神經(jīng)元內(nèi)部蛋白質(zhì)的相互作用,如突觸形成、神經(jīng)遞質(zhì)釋放、離子通道調(diào)控等。

    ● 癌癥研究:研究致癌基因與抑癌基因、癌蛋白與微環(huán)境因素的相互作用,揭示癌癥發(fā)生發(fā)展的分子機制,為診斷、預(yù)后評估和個性化治療提供依據(jù)。

BIFC實驗優(yōu)化與注意事項

    ● 融合片段選擇:選擇對熒光蛋白功能影響較小的片段融合位點,確保片段重組后熒光蛋白功能恢復(fù)。

    ● 熒光蛋白選擇:考慮熒光蛋白的亮度、穩(wěn)定性、光譜特性等因素,選擇最適合實驗條件的熒光蛋白。

    ● 對照設(shè)置:包括陰性對照(表達(dá)單個熒光蛋白片段的細(xì)胞)和陽性對照(已知存在相互作用的蛋白質(zhì)對)。

    ● 轉(zhuǎn)染效率與表達(dá)水平監(jiān)控:確保細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率足夠高,且融合蛋白表達(dá)水平適中,避免過表達(dá)干擾。

BIFC實驗設(shè)計與結(jié)果解讀

載體構(gòu)建

 

    如上圖所示,BiFC系統(tǒng)包含兩個質(zhì)粒,一個質(zhì)粒上帶有到Y(jié)FP蛋白的N端173個氨基酸,另一個質(zhì)粒上帶有YFP蛋白C端155個氨基酸。將待測蛋白A和B分別構(gòu)建到兩個載體上,與YFP的N部分和C部分分別融合表達(dá),如果A和B蛋白能夠結(jié)合,則YFP的兩個部分也能重新組合在一起發(fā)出熒光。載體上分別帶有Myc標(biāo)簽和HA標(biāo)簽,供WB驗證。

結(jié)果解讀

轉(zhuǎn)染煙草后拍照檢測

    ● 默認(rèn)分組方式如上圖所示,每組每個視野都會拍攝熒光、明場以及融合3張照片;

    ● “YN173-P1 + YC155-P2”為陽性對照,“P1”和“P2”是已知能夠互作的蛋白;

    ● “YN173 + YC155”為陰性對照,轉(zhuǎn)染的一對空載質(zhì)粒,不會檢測到熒光;

    ● “YN173-A + YC155-B”為實驗組,“A”和“B”指代待驗證是否互作的一對蛋白,在陰陽性對照正常的情況下,如果實驗組能檢測到熒光,說明兩個蛋白能夠互作,反之說明兩個蛋白不能互作;

    ● “YN173-A + YC155”和“YN173 + YC155-B”為單分子對照組,同陰性對照不會檢測到熒光。

    ● 由于融合表達(dá)蛋白空間構(gòu)象的問題,有時在沒有檢測到互作的情況下,調(diào)換兩個蛋白的BiFC載體重新驗證,又能夠檢測到互作。




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