RIP技術（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA結合蛋白免疫沉淀），是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具。該技術主要是運?目標蛋?的特異性抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，然后經過分離純化對結合在復合物上的RNA進行q-PCR驗證或者高通量測序分析。

Q1：如何判斷RIP實驗成功？

RIP后WB檢測IP組和input組檢測到目的蛋白信號即判斷RIP實驗成功。

Q2：IP和IgG樣本Ct值沒有差異

多方面原因造成：

1.抗體沒有富集到RNA，可更換抗體嘗試；

2.IgG背景過高，可增加洗滌次數或減少免疫沉淀步驟RNA投入量。

Q3：溶解曲線異常

出現非特異擴增或有引物二聚體等情況，需重新設計引物。

Q4：拉下樣本RNA濃度過低

1.樣本投入量過少，考慮增加樣本初始投入量。

2.裂解不完全，組織樣本未研磨充分，或者用強裂解液進行裂解。

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