服務介紹
基因合成是指利用化學方法將一段完整的DNA序列合成成一條完整的DNA分子的過程,通常通過連接短的寡核苷酸序列逐步合成長鏈DNA。基因合成技術可以根據需求設計合成包括蛋白質編碼序列、RNA干擾分子、基因表達調控元件等各種功能元件。這項技術在現代生命科學、醫學研究、生物制藥等領域都有著廣泛的應用,可以為研究人員提供一種快速、高效的合成DNA分子的方法,為基因工程和基因組學研究提供了有力支持。
服務優勢
- 自主研發的超長識別序列核酸內切酶能精確切割雙鏈DNA,且酶切位點可以根據要求定制,可用于基因大片段的組裝,為合成生物學又添一件利刃。
- 自主研發的超低反應溫度多段重組酶,反應、轉化均可在冰上進行,真正實現“One Step”。
- 新技術工藝更穩定,周期更短,價格更實惠。
服務流程
客戶提供
基因序列或蛋白質氨基酸序列
最終交付
- 約4 μg含有目的片段的高純度凍干質粒DNA;
- 含有重組質粒的穿刺菌或甘油菌一管(默認菌株為TOP10具體以樣品管壁標簽為準);
- 發貨文件主要包括如下內容:測序結果、COA報告、sqd文件、seq文件。
服務說明
服務內容 | 基因長度 | 周期 |
基因合成 |
0~1kb |
7 |
1kb~2kb | 8-13 | |
2kb~3kb | 12-17 | |
3kb~4kb | 16-20 | |
4kb~5kb | 20-25 | |
5kb~6kb | 25-30 | |
大于6kb | 咨詢 |
案例展示
相關資源
1、基因合成實驗中涉及到的一些專屬名詞及釋義
● 寡核苷酸:由較少數量的核苷酸單元組成的短鏈,常用作DNA合成過程中的引物。
● 固相合成:一種常用的DNA合成方法,其中DNA鏈在固相材料(通常是小顆粒)上逐漸構建,通過逐步添加單個核苷酸單元來進行。
● PCR(聚合酶鏈式反應):一種常用的DNA復制技術,通過不斷循環的變溫步驟,在體外擴增和復制目標DNA序列。
● 載體:用于將合成的DNA序列轉移到細胞中的DNA分子。常見的載體包括質粒、病毒或合成的DNA片段。
● 克隆:將DNA插入到載體中的過程,形成克隆DNA。克隆可用于擴增、保存和研究特定的DNA序列。
2、涉及基因合成的實驗舉例
實驗類型 |
使用基因合成的應用 |
合成可變區域(variable region)或全長重鏈和輕鏈的基因序列,以構建定制的抗體。 | |
雙熒光素酶報告基因實驗 |
構建包含雙熒光素酶基因的報告基因載體,用于監測目標基因的表達水平和調控機制。 |
RNA干擾(RNAi)實驗 |
合成小干擾RNA(siRNA)或小核苷酸發夾(shRNA),以抑制目標基因的表達。 |
CRISPR-Cas9基因編輯實驗 |
合成CRISPR RNA(crRNA)和轉錄單元(tracrRNA),用于導向Cas9蛋白靶向基因組中的特定位點,實現基因編輯和修飾。 |
蛋白質標記實驗 |
構建帶有特定標簽序列的蛋白質表達載體,用于蛋白質的純化、定位和可視化,如融合標簽(如His標簽、GST標簽)或熒光標簽(如GFP標簽)等。 |
克隆和表達實驗 |
合成目標基因的DNA序列,并將其插入表達載體中,以實現目標基因的表達和產生特定蛋白質。 |
DNA納米技術實驗 |
利用基因合成構建DNA納米結構和納米器件,用于生物傳感、藥物傳遞、分子計算等應用。 |
基因組重編程實驗 |
合成和設計基因組的改造,以研究基因組的功能、調控和重編程。 |
3、基因合成中用于設計、分析和操作合成的工具簡介
工具 |
功能 |
ApE (A plasmid Editor) |
用于DNA序列編輯和分析的免費軟件,可以進行序列標記、限制酶切位點分析、引物設計等。 |
SnapGene |
用于DNA序列設計、分析和模擬的商業軟件,提供直觀的界面和許多實用功能,如序列編輯、PCR模擬、蛋白質序列注釋等。 |
Vector NTI |
商業軟件套件,用于DNA序列設計、分析和操作。它提供了多種工具,包括序列比對、引物設計、限制酶切位點分析等 |
Serial Cloner |
免費的DNA序列編輯和分析軟件,提供基本的序列操作和分析功能,如序列標記、PCR引物設計、限制酶切位點分析等。 |
Primer3 |
用于設計PCR引物的廣泛使用的免費在線工具,根據給定的參數和目標序列自動設計引物。 |
OligoAnalyzer |
用于評估DNA或RNA序列的理化特性和引物設計的免費在線工具。可以預測引物的熔解溫度、GC含量、二級結構和互補性等參數。 |
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) |
用于序列比對和相似性搜索的免費在線工具,可以在數據庫中搜索與給定序列相似的序列。 |
EMBOSS (European Molecular Biology Open Software Suite) |
提供一系列免費的生物信息學工具,用于DNA序列分析,如ORF預測、限制酶切位點分析、序列比對等。 |
UCSC Genome Browser |
提供基因組序列和注釋的在線瀏覽器,可以檢索和分析各種物種的基因組信息。 |
Benchling |
商業化實驗室操作平臺,用于設計、分析和操作DNA序列。提供了多種實用功能,如序列編輯、引物設計、限制酶切位點分析、克隆等。 |
4、基因合成失敗及原因分析
①合成產物不存在/未擴增成功:
● 引物設計問題:引物序列選擇不當,導致與目標序列不特異結合。
● 引物合成問題:引物質量不佳,包括錯配、缺失或雜質。
● PCR條件問題:PCR反應條件不正確,如溫度、時間和酶濃度等。
②擴增產物存在雜交/非特異性擴增:
● 引物設計問題:引物與其他非目標序列存在非特異性結合。
● 目標序列復雜性問題:目標序列具有高度變異性或復雜結構,導致引物無法特異性結合。
③擴增產物存在多個帶或模糊帶:
● 引物設計問題:引物選擇不當,導致非特異性擴增或引物間的非特異性結合。
● 目標序列問題:目標序列存在拷貝數變異或基因組重復區域,導致擴增產物不明確或雜交特異性差。
④擴增產物偏低/低效:
● 引物設計問題:引物長度不合適或GC含量偏高或偏低,影響引物的特異性和擴增效率。
● PCR條件問題:PCR反應條件不適當,如溫度、時間和酶濃度等。
● 目標序列問題:目標序列可能具有復雜結構或高度變異性,使擴增困難。
⑤引物降解或污染:
● 引物貯存問題:引物儲存條件不當,如暴露在高溫或濕度環境下,導致引物的降解和損壞。
● 污染問題:實驗操作中引物、試劑或反應管的污染,影響擴增結果。