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信息來源:金開瑞 作者:genecreate 發布時間:2021-03-12 17:04:44


酵母單雜交技術是在酵母雙雜基礎上發展而來的一種研究核酸-蛋白相互作用的工具,被廣泛用于研究真核細胞內基因的表達調控,如鑒別DNA結合位點發現潛在的結合蛋白基因、分析DNA結合結構域信息等。

二、核蛋白酵母雙雜交
核蛋白酵母雙雜交技術最初由Fields等人在研究酵母轉錄因子GAL4性質時建立,后續經過不斷改進已發展成為一種成熟的蛋白-蛋白互作研究工具,具有簡便、靈敏、可反映蛋白在活細胞內互作真實情況的特點,被廣泛應用于互作蛋白的篩選、蛋白相互作用的鑒定/驗證、蛋白互作機理的探究、蛋白連鎖圖譜繪制等工作。

三、核酵母單/雙雜交點對點驗證流程簡介及圖片分析
A為誘餌,B為獵物。篩選涉及到的報告基因:
(1)HIS3。
(2)ADE2。
(3)MEL1。
誘餌質粒PGBKT7攜帶trp基因, , 獵物質粒PGADT7攜帶Leu基因。
篩選涉及到的平板:DDO[SD/-Leu/-Trp],DDO/X[SD/-Leu/-Trp/X-α-gal],TDO /X [SD/-Leu/-Trp/HIS3/X-α-gal],QDO /X[SD/-Leu/-Trp/HIS3/Ade2/X-α-gal]
1、誘餌自激活驗證

分析:誘餌質粒重組質粒PGBKT7-A和獵物空載PGADT7共轉化Y2Hgold酵母菌株。(1)涂布DDO平板能夠生長,說明誘餌PGBKT7-A+ PGADT7已成功轉入宿主菌中且對宿主菌無毒性;(2)涂布TDO平板,不能生長,說明誘餌PGBKT7-A+ PGADT7無自激活現象,不能激活宿主菌報告基因his的表達;(3)涂布QDO平板沒長,說明誘餌PGBKT7-A+ PGADT7無自激活現象,沒有激活報告基因ADE2。
2、共轉驗證——陰陽性對照

3、共轉驗證——實驗組

分析:誘餌重組質粒PGBKT7-A和獵物重組PGADT7-B共轉化Y2Hgold酵母菌株。(1)涂布DDO平板能夠生長,說明誘餌PGBKT7-A+ PGADT7-B已成功轉入宿主菌中且對宿主菌無毒性;(2)涂布TDO平板能生長,說明誘餌PGBKT7-A+ PGADT7-B能夠互作,激活了宿主菌報告基因HIS3的表達;(3)涂布QDO平板能長,說明誘餌PGBKT7-A+ PGADT7-B能夠互作,同時激活了報告基因HIS3和ADE2的表達。
4、雙雜點種圖


1自激活: Y2H[PGBKT7-A+ PGADT7]
2實驗組: Y2H[PGBKT7-A+ PGADT7-B]
3陽性對照: Y2H[pGBKT7-53+pGADT7-T]
4陰性對照: Y2H[pGBKT7-lam+pGADT7-T]
5、酵母單雜點對點驗證示意圖
P為誘餌啟動子,B為獵物。
單雜篩選報告和抗性基因:
AbAr/ AUR-C,AUR1基因的一個顯性突變版本,編碼肌醇磷酸化神經酰胺syn- thase酶。AUR1-C在Y2HGold/ Y1HGold酵母株中表達,是由于蛋白質與蛋白質的相互作用,使GAL4轉錄激活和DNA結合域接近??梢蕴砑覣BA進行背景抑制。,
誘餌質粒PABAI攜帶Ura基因,獵物質粒PGADT7攜帶Leu基因。
篩選所用到的平板:SD/- Leu,SD/- Leu/+AbA

自激活結果分析:PGADT7空載轉化含誘餌啟動子PAbAi-PY1Hgold酵母菌株。
(1)涂布SD/-Leu平板能夠生長,說明誘餌PAbAi-P已成功轉入宿主菌中且對宿主菌無毒性;
(2)涂布SD/-Leu/AbA(100ng/ml), SD/-Leu/AbA(200ng/ml) 平板能生長,說明200ng/ml的AbA不能抑制報告基因AbAr/ AUR-C ;
(3)涂布SD/-Leu/AbA(500ng/ml) ,SD/-Leu/AbA(800ng/ml),SD/-Leu/AbA(1000ng/ml)平板沒長,說明能夠抑制報告基因AUR1-C的最低AbA濃度為500ng/ml,后續可用AbA(500ng/ml)進行共轉驗證。如果AbA最高抑制濃度1000ng/ml仍然能夠生長,則只能考慮截短誘餌啟動子。
6、共轉驗證——陰陽性對照

7、共轉驗證——實驗組

分析:誘餌啟動子重組質粒PAbAi-P轉化Y1Hgold酵母菌株涂布SD/-Ura平板,挑取單克隆菌制備成感受態,將獵物重組質粒PGADT7-B轉化到Y1Hgold【 PAbAi-P 】中。(1)涂布SD/- Leu平板能夠生長,說明獵物重組質粒PGADT7-B已成功轉入宿主菌中且對宿主菌無毒性;(2)涂布SD/- Leu /+AbA (500ng/ml)平板能生長,說明誘餌PAbAi-P + PGADT7-B能夠互作,激活了宿主菌報告基因AbAr/ AUR-C的表達。
8、單雜稀釋點種圖

四、酵母單/雙雜點對點技術優勢:
1. 轉化效率高,較少假陰性;2. 設置嚴格的對照實驗,排除假陽性和假陰性;
3. 酵母雙雜系統采用多個報告基因,且每個報告基因上游調控區各不相同,可大幅度減少假陽性;
4. 報告基因整合到染色體上,使基因表達水平穩定,消除了由于質??截悢底兓鸹虮磉_水平波動而造成的假陽性;
5. 嚴格設置點種驗證實驗菌體生長狀態,進一步驗證是否互作及互作強弱;
6. 嚴格保存原始實驗數據便于溯源。
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