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翻譯后修飾蛋白組

翻譯后修飾蛋白組

  • 磷酸化蛋白組
  • 乙酰化蛋白組
  • 泛素化定量蛋白質組學
  • 甲基化定量蛋白質組學

服務特色

蛋白質翻譯后修飾(PTMs)幾乎參與了細胞所有正常生命活動的過程,在信號轉導和調控中發揮十分重要的作用。蛋白修飾已經成為國際上蛋白質研究的一個極其重要的領域。金開瑞結合先進的LC-MS/MS系統分析和生物信息學分析技術,提供磷酸化、乙酰化等蛋白質修飾鑒定和定量技術服務。

服務介紹

磷酸化定量蛋白質組學:

蛋白質磷酸化是生物體中最常見、最重要的一種蛋白質翻譯后修飾方式,它可以通過激發、調節諸多信號通路進而參與調控生物體的生長、發育、逆境應激、疾病發生等多種生命過程,所以磷酸化一直是生物學研究的重點與熱點。磷酸化蛋白質組 (Phosphoproteomics)以組織、細胞等較為復雜樣本為研究對象,目的在于鑒定樣品中發生磷酸化的蛋白質以及相應的磷酸化位點。

乙酰化定量蛋白質組學:

蛋白質的乙酰化修飾是在乙酰基轉移酶的作用下,蛋白質的賴氨酸殘基上添加乙酰基的過程,是細胞控制基因表達、蛋白質的活性或生理過程的一種機制。乙酰化主要集中在對細胞染色體結構的影響以及對核內轉錄調控因子的激活方面,還參與細胞周期和新陳代謝、肌動蛋白聚合控制。乙酰化蛋白質組以組織、細胞等較為復雜樣本為研究對象,目的在于鑒定樣品中發生乙酰化的蛋白質以及相應的乙酰化位點。

泛素化定量蛋白質組學

蛋白質泛素化修飾是一種在細胞內廣泛存在的重要蛋白質翻譯后修飾方式。這種修飾通過連接泛素分子到目標蛋白上,調控蛋白質的功能、穩定性和位置,參與多種細胞生物學過程,包括蛋白質降解、細胞周期調控、DNA修復和信號轉導等。泛素化定量蛋白質組學以復雜樣本如細胞、組織等為研究對象,目的在于鑒定樣品中發生泛素化修飾的蛋白質以及相應的泛素化修飾位點。

乳酸化定量蛋白質組學

蛋白質乳酸化修飾是一種新近發現的蛋白質翻譯后修飾方式,涉及將乳酸基團添加到蛋白質的賴氨酸殘基上,是一種重要的代謝修飾方式。乳酸化定量蛋白質組學以組織、細胞等較為復雜樣本為研究對象,目的在于鑒定樣品中發生乳酸化修飾的蛋白質以及相應的乳酸化修飾位點。

甲基化定量蛋白質組學

蛋白質甲基化修飾是一種常見的蛋白質翻譯后修飾方式,涉及在蛋白質上添加甲基基團,通過酶催化反應在賴氨酸、精氨酸或其他氨基酸殘基上引入甲基化修飾。甲基化定量蛋白質組學以組織、細胞等較為復雜樣本為研究對象,目的在于鑒定樣品中發生甲基化修飾的蛋白質以及相應的甲基化修飾位點。

服務優勢

  • 全面解析修飾類型:翻譯后修飾蛋白組學可以全面解析蛋白質的不同類型的翻譯后修飾,包括磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等多種修飾,幫助揭示蛋白質的多樣化功能。
  • 高通量技術:該技術支持高通量樣本處理,能夠同時分析多個樣本,加快研究進程,提高實驗效率。
  • 高靈敏度和準確性:該技術采用高分辨質譜儀進行分析,具有高靈敏度和準確性,能夠檢測低豐度修飾蛋白質,并提供可靠的定量信息。
  • 大規模數據分析:翻譯后修飾蛋白組學能夠進行大規模數據分析,處理復雜的樣本,識別大量的修飾位點,為深入研究蛋白質功能和調控提供全面的信息。
  • 個性化定制:根據不同研究目的,可以定制化實驗方案,針對不同樣本類型和修飾類型進行研究,滿足客戶的個性化需求。

服務流程

接受訂單及樣品
蛋白提取
蛋白酶解
修飾肽段富集
LC-MS/MS
數據解析
結果交付

客戶提供

需鑒定的樣品;

樣品信息單:需詳細填寫樣品來源、含量、狀態及其他基本信息。

最終交付

  • 實驗報告一份,含具體實驗流程及蛋白質組鑒定及定量結果(生物信息學分析)。
  • 生物信息學分析內容包括: 1. 修飾蛋白、修飾位點鑒定; 2. 鑒定結果特征分布:肽段長度、蛋白覆蓋度分布、unique肽段分布; 3. 修飾位點motif預測; 4. 蛋白質GO功能分類、COG注釋、Pathway通路注釋; 5. 蛋白質網絡互作預測;

服務說明

平臺

產品類型

項目周期

技術指標

樣本數量(單次送樣個數)

3D平臺

TMT 磷酸化蛋白組學

30個自然日

Thermo Q Exactive HF(X)系統

不少于6個樣

TMT 甲基化組學(精氨酸甲基化)

35個自然日

TMT 乙酰化蛋白組學

30個自然日

TMT 乳酸化蛋白組學

35個自然日

LFQ 乳酸化蛋白組學

30個自然日

4D平臺

4D 泛素化label free

30個自然日

tims TOF pro

<20

20≤X≤50

>50

4D 乙酰化label free

30個自然日

tims TOF pro

<20

20≤X≤50

>50

4D 磷酸化label free

40個自然日

tims TOF pro,默認TiO2富集,可選Imac。

<20

20≤X≤50

>50

相關技術服務

蛋白鑒定                                ● 4D DIA定量蛋白組            ● iTRAQ/TMT定量蛋白組

● Label-free定量蛋白組            ● PRM                                 ● 糖蛋白質組學分析服務

相關資源

1、翻譯后修飾蛋白組學在生物學和醫學研究中有廣泛的應用

    ● 蛋白質功能研究:通過分析蛋白質的翻譯后修飾,可以揭示蛋白質的功能和調控機制,包括信號傳導、細胞周期調控、代謝途徑等。

    ● 生物標志物發現:翻譯后修飾蛋白組學可以發現與疾病相關的生物標志物,用于疾病早期診斷和治療監測。

    ● 藥物開發:對藥物靶點蛋白的翻譯后修飾進行研究,有助于優化藥物設計和開發更有效的治療藥物。

    ● 細胞信號通路研究:通過翻譯后修飾蛋白組學,可以深入了解細胞信號通路的調控機制和相互作用。

    ● 癌癥研究:翻譯后修飾蛋白組學在癌癥研究中具有重要意義,可以揭示腫瘤發生和發展過程中的蛋白質修飾變化,為癌癥治療提供新的靶點和策略。

    ● 細胞代謝調控:翻譯后修飾蛋白組學有助于研究細胞代謝調控的機制,對代謝性疾病如糖尿病等的研究具有重要意義。


2、蛋白翻譯后修飾功能簡介(部分示例)

修飾類型

英文名稱

修飾功能

磷酸化

Phosphorylation

調節蛋白酶活性,信號傳導,細胞增殖和凋亡

乙酰化

Acetylation

調節蛋白穩定性,轉錄調控,基因表達和細胞周期

泛素化

Ubiquitination

調節蛋白降解,細胞周期調控,DNA修復和膜蛋白定位

甲基化

Methylation

調節基因表達,蛋白亞細胞定位,染色質結構和細胞分化

糖基化

Glycosylation

調控蛋白折疊,穩定性,細胞信號傳導和病毒入侵

琥珀酰化

Succinylation

調節蛋白降解,信號傳導,基因表達和DNA修復

巴豆酰化

Butyrylation

調控蛋白穩定性,轉錄活性,細胞周期和細胞分化

乳酸化

Lactylation

調節蛋白功能,能量代謝,細胞信號傳導和代謝途徑調控

甲基丙烯酰化

Malonylation

調節蛋白功能和相互作用,影響細胞增殖,轉錄和細胞周期

硝化

Nitrosylation

調節蛋白酶活性,信號傳導,細胞凋亡和免疫反應

脂肪酰化

Palmitoylation

調節蛋白穩定性,細胞信號傳導,細胞周期和細胞凋亡

丙二醛化

Propionylation

調節蛋白穩定性,細胞凋亡,抗氧化應激和細胞信號傳導

泛素樣修飾

SUMOylation

調節蛋白酶活性,蛋白降解,細胞凋亡和DNA損傷修復

絲氨酰化

Serotonylation

調節蛋白功能,DNA損傷應答,細胞周期和細胞增殖

硫化

Sulfhydration

調節蛋白穩定性,氧化還原平衡,細胞凋亡和細胞周期

硝酸化

Nitrosation

調節蛋白穩定性,細胞信號傳導,細胞增殖和免疫應答

溴化

Bromination

調節蛋白功能,DNA損傷修復,細胞周期和細胞增殖

磷酸膽堿化

Phosphocholination

調節蛋白穩定性,信號傳導,細胞增殖和細胞凋亡

戊酰化

Glutarylation

調節蛋白穩定性,細胞信號傳導,細胞增殖和細胞凋亡

丙二酰化

Propionylation

調節蛋白功能和相互作用,影響細胞增殖,轉錄和細胞周期

丁酸化

Butyrylation

調控蛋白穩定性,轉錄活性,細胞周期和細胞分化

苯甲酰化

Benzoylation

調節蛋白功能,信號傳導,細胞凋亡和DNA損傷修復

 

3、蛋白修飾如何確認?

蛋白修飾的確認方法可以分為多種技術,其中一些常見的方法包括:

    ● 質譜分析:質譜是一種高效準確的蛋白修飾鑒定方法,包括磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等。質譜可以通過檢測質譜峰的質量和相對豐度來確定修飾位點和修飾類型。

    ● 免疫檢測:使用特異性抗體來檢測特定的蛋白修飾,例如磷酸化、乙酰化等。Western blot免疫組織化學是常用的免疫檢測方法。

    ● 電泳分析:蛋白質電泳分析可以用于檢測蛋白質泛素化、泛素鏈的長度和形態等修飾。

    ● 核磁共振譜(NMR):NMR可以用于解析蛋白質的三維結構,從而確定是否存在特定的修飾。

    ● 序列分析:通過分析蛋白質序列中特定的修飾位點,結合生物信息學工具,可以預測可能的修飾類型。

    ● 酶消化:使用特定酶來消化蛋白質,從而鑒定修飾位點。

    ● 結構生物學方法:如X射線晶體學、冷凍電鏡等可以揭示蛋白質的結構,幫助解析修飾的位置和類型。

    不同的蛋白質修飾可能需要不同的確認方法,研究人員根據具體的研究問題和修飾類型選擇合適的方法來確認蛋白質修飾。綜合運用多種技術可以更全面地了解蛋白質修飾的類型和功能。

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