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國科金專題輔導(dǎo)講座回顧 || 腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)專題（內(nèi)含課件）

信息來源：金開瑞作者：genecreate 發(fā)布時(shí)間：2020-06-01 16:33:37

時(shí)至三月，國自然考試已悄然進(jìn)入“最后沖刺階段”，國科金申請(qǐng)書到底怎么修改才好？縱觀歷年國自然申請(qǐng)情況，客觀準(zhǔn)確地挖掘關(guān)鍵機(jī)制、篩選關(guān)鍵因子，對(duì)于基金中標(biāo)至關(guān)重要。

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)因其高通量、客觀、穩(wěn)定等特性成為面上乃至重大項(xiàng)目的中標(biāo)利器之一。將蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù)方法應(yīng)用到腫瘤生物學(xué)的研究中,產(chǎn)生了一門新學(xué)科——腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)。腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)經(jīng)歷了表達(dá)譜、修飾譜到活性譜的進(jìn)化過程,在不同的層面上揭示腫瘤可能的致病機(jī)制。研究統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn)腫瘤相關(guān)審報(bào)項(xiàng)目數(shù)目和腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)文獻(xiàn)也呈逐年快速增長趨勢(shì)。

什么是蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)？
腫瘤/癌癥蛋白質(zhì)組學(xué)有哪些重要資源？
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有哪些應(yīng)用？
腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)課題研究思路有哪些？

在上期題為《國科金專題輔導(dǎo)講座--蛋白質(zhì)組學(xué)專題的》講座中，趙老師就以上內(nèi)容做出了詳細(xì)解答，線上聽課人數(shù)高達(dá)800+，反響非常熱烈。在此我們要再次感謝各位專家老師的認(rèn)可與信賴！我們將一如既往地提供優(yōu)質(zhì)講座服務(wù)給大家，希望對(duì)您的科研事業(yè)有所助益！

以下是上期講座精彩回顧，請(qǐng)您雅鑒~ ~

腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)課題總結(jié)

研究耐藥機(jī)制

• 補(bǔ)體膜調(diào)控蛋白參與腫瘤抗體治療耐藥的分子機(jī)制

• PDGFD的表觀遺傳學(xué)調(diào)控及其在腫瘤耐藥中的作用

• 成纖維細(xì)胞激活蛋白響應(yīng)的腫瘤及腫瘤微環(huán)境雙靶向給藥系統(tǒng)的研究

發(fā)現(xiàn)腫瘤相關(guān)的特定信號(hào)通路

• SR蛋白通過Wnt信號(hào)調(diào)控腫瘤細(xì)胞增殖的機(jī)制研究

• LMO2調(diào)控前列腺癌惡化和轉(zhuǎn)移相關(guān)的信號(hào)通路與蛋白質(zhì)組學(xué)研究

• TLRs信號(hào)通道對(duì)Hh-LPS致肝細(xì)胞線粒體蛋白質(zhì)組影響的分子機(jī)理

腫瘤發(fā)生的機(jī)制研究

• 腫瘤相關(guān)蛋白調(diào)控細(xì)胞凋亡過程的分子模擬研究

• 蛋白修飾導(dǎo)致SH3BGRL在腫瘤中表達(dá)上調(diào)及在腫瘤發(fā)生、轉(zhuǎn)移中的機(jī)理

• PTEN家族蛋白在腫瘤代謝異常中的調(diào)控機(jī)制研究

腫瘤免疫應(yīng)答及機(jī)制研究

• 抗體識(shí)別腫瘤MUC1糖肽的分子免疫學(xué)機(jī)制研究

• 腫瘤源性骨橋蛋白誘導(dǎo)髓系抑制性細(xì)胞促進(jìn)腫瘤免疫逃逸機(jī)制研究

• STING蛋白調(diào)節(jié)樹突狀細(xì)胞介導(dǎo)的腫瘤免疫研究

• 結(jié)核分枝桿菌熱休克蛋白65-腫瘤細(xì)胞裂解物抗肺癌疫苗的改進(jìn)研究

腫瘤診斷

• 基于MRM技術(shù)的血清免疫球蛋白腫瘤特異性糖多肽的鑒定及其聯(lián)合CEA精準(zhǔn)診斷結(jié)直腸癌的應(yīng)用

• 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)用于急性白血病診斷及分型的研究

• 基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)和血清蛋白質(zhì)組學(xué)包蟲病診斷標(biāo)志物的篩選及其免疫應(yīng)答機(jī)制的研究

• 免疫蛋白質(zhì)組學(xué)篩查、鑒定具有早期診斷價(jià)值的人胰腺癌相關(guān)膜抗原

腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)的重要資源

蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)課題一般設(shè)計(jì)思路

蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)文章的最低要求：前三步驟，后三步屬于加分項(xiàng)（10分以下）

大樣本量蛋白質(zhì)組學(xué)也成為當(dāng)前科研趨勢(shì)，即大量樣品蛋白質(zhì)組學(xué)測量，然后數(shù)據(jù)深度挖掘，少量驗(yàn)證（CNS或其子刊級(jí)別）

相關(guān)性研究：少量樣本發(fā)現(xiàn) + 大量樣本驗(yàn)證

機(jī)制研究：先通過組學(xué)手段發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因（或/和翻譯后修飾狀態(tài)的變化），再通過一系列下游的分子實(shí)驗(yàn)闡明其作用機(jī)制，往往同時(shí)結(jié)合第4-6步

腫瘤標(biāo)志物研究案例

生理病理機(jī)制研究案例

1. Proteasome machinery is instrumental in a common gain-of-function program of the p53 missense mutants in cancer. Nature Cell Biology. IF:19

2. Quantitative proteomics using SILAC‐MS identifies N‐acetylcysteine‐solution‐triggered reversal response of renal cell carcinoma cell lines. Journal of Cellular Biochemistry. IF: 3.1

3. p53 pathway dysfunction is highly prevalent in acute myeloid leukemia independent of TP53 mutational status. Leukemia. IF:12.1

4. Identification and Characterization of Potential Biomarkers by Quantitative Tissue Proteomics of Primary Lung Adenocarcinoma[J]. Molecular & Cellular Proteomics Mcp, IF:5.7

5. Photocatalyzing CO2 to CO for Enhanced Cancer Therapy[J]. Advanced Materials. IF:21.95

藥物靶標(biāo)篩選案例

1. PDGF receptors as cancer drug targets. Cancer Cell.IF: 22.8

2. miR-122 Targets X-Linked Inhibitor of Apoptosis Protein to Sensitize Oxaliplatin-Resistant Colorectal Cancer Cells to Oxaliplatin-Mediated Cytotoxicity. Cell Physiol Biochem. IF:5.5

3. G protein-coupled receptors: novel targets for drug discovery in cancer. Nat Rev Drug Discov. IF: 50.16

總結(jié)

腫瘤的主要研究熱點(diǎn)

? 更好的診斷方法

? 更好的治療方法（個(gè)性化診療）

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)介紹

? iTRAQ定量技術(shù)，一種同位素標(biāo)記的定量方法，使用廣泛

? SWATH/DIA定量技術(shù)，一種新的全掃描的定量技術(shù)，有望取代其他定量技術(shù)

? PRM/MRM 靶向定量技術(shù)，對(duì)基于“發(fā)現(xiàn)”水平的差異表達(dá)蛋白的驗(yàn)證

蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤臨床研究中的應(yīng)用

? 腫瘤標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)組學(xué)策略

? 腫瘤發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制研究策略

? 個(gè)性化診療的基本思路

武漢金開瑞蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái)

平臺(tái)引進(jìn)了先進(jìn)的SCIEX TripleTOF 5600 + 液質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)、 Q Exactive™ HF 組合型四極桿-Orbitrap MS，可提供蛋白質(zhì)鑒定、定量蛋白質(zhì)組、修飾蛋白質(zhì)組、互作蛋白質(zhì)組等全方位的蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)服務(wù)。

穩(wěn)定的實(shí)驗(yàn)方案，嚴(yán)格的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)，專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，提供個(gè)性化數(shù)據(jù)分析和終身免費(fèi)售后，可保證您的實(shí)驗(yàn)達(dá)到最優(yōu)效果。

自平臺(tái)成立至今，已服務(wù)了500+家高校、科研院所、醫(yī)院，遍布全國各地；完成了萬例個(gè)生物樣本，分析的物種達(dá)180多種，囊括了從模式生物到普遍高等動(dòng)植物到細(xì)菌、真菌和病毒等幾乎所有類型物種；涉及的樣本類型從動(dòng)物各類組織器官、各種細(xì)胞系、植物各類組織以及多種動(dòng)物體液（血液、尿液、腦脊液、唾液、毒液等）到微生物菌體及病毒。

部分客戶已發(fā)表文獻(xiàn)

Photo-Powered Artificial Organelles for ATP Generation and Life-Sustainment. Advanced Materials (IF=21.95), 2018. (合作技術(shù)：Label-free)

Photocatalyzing CO2 to CO for Enhanced Cancer Therapy. Advanced Materials (IF=21.95), 2017. (合作技術(shù)：iTRAQ)

Exome-wide analysis identifies three low-frequency missense variants associated with pancreatic cancer risk in Chinese populations. Nature Communications (IF=12.353), 2018. (合作技術(shù)：磷酸化iTRAQ)

Optically-controlled bacterial metabolite for cancer therapy. Nature Communications (IF=12.353), 2018. (合作技術(shù)：iTRAQ)

Combined spectroelectrochemical and proteomic characterizations of bidirectional Alcaligenes faecalis-electrode electron transfer. Biosensors & Bioelectronics (IF=8.173), 2018. (合作技術(shù)：SWATH)

Chemical Signals Stimulate Geobacter soli Biofilm Formation and Electroactivity. Biosensors & Bioelectronics (IF=8.173), 2019. (合作技術(shù)：SWATH)

福利時(shí)間

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