CUT&Tag（CleavageUnderTargetsandTagmentation)，即靶向剪切及轉座酶技術，是?種利用酶錨定技術進行高效、高分辨率的DNA測序文庫構建方法，也是替換傳統的ChIP-Seq用以研究蛋白質-基因組互作關系研究的新方法，屬于新?代超微量ChIP-Seq技術。可用于檢測組蛋白、RNApolymeraseII和轉錄因?等具有DNA結合功能的蛋白種類，對表觀遺傳學、腫瘤和干細胞等 領域的研究具有重要意義。

    結合了ChIP-seq的優點和基于Tn5轉座酶的tagmentation方法，能夠快速、高效地鑒定染色質上蛋白質的結合位點。相較于傳統的ChIP-seq技術，Cut&Tag具有更快的實驗速度、更高的分辨率和更低的細胞輸?要求。

01/原理簡介

    在抗體引導下，ChiTag酶僅在目的組蛋白修飾標志、轉錄因?、染色質調控蛋白結合染色質的局部進?目的 DNA的?段化的同時添加測序接頭，并釋放到細胞外，而絕大部分無關的染色質還留在細胞核內，因而整個實驗的信噪?大幅提高，同時簡化了實驗步驟。該方法可?管式高通量應?，并可與單細胞測序平臺「無縫」結合。ChiTag酶在打斷基因組的同時加上接頭，不需要繁瑣的補平加A加接頭，在?天內可以完成從細胞到測序文庫制備全流程。

02/實驗流程

03/服務優勢

CUT&Tag與ChIP-Seq?較

04/文獻解讀

1.YY1保護與擴展多能性相關的多維表觀遺傳景觀

    具有形成胚胎和胚胎外譜系的潛?的胚胎?細胞（ESCs）稱為擴展多能?細胞（EPSCs）。2022年研究?員運?CUT&TAG、ATAC-seq、Hi-C等技術探究EPSC多維度表觀調控機制。結果表明，轉錄因?Yy1與EPSC中特定的開放染色質區域結合。Yy1缺失導致DNA低甲基化，并通過促進CCCTC結合因?(CTCF)介導的圍繞其基因座的EP相互作?的形成，上調Kdm5c和Hdac6的表達，從而顯著降低H3K4me3和H3K27ac在EPSC特異性基因啟動?上的富集。

參考文獻：

DongX,GuoR,JiT,ZhangJ,XuJ,LiY,ShengY,WangY,FangK,WenY,LiuB,HuG,DengH,YaoH.YY1safeguardmultidimensionalepigeneticlandscapeassociatedwithextendedpluripotency.NucleicAcidsRes.2022Nov28;50(21):12019-12038.doi:10.1093/nar/gkac230.

2.表觀遺傳閱讀器SP140功能喪失導致克羅恩病

    斑點蛋白140(SP140)是?種免疫受限的植物同源結構域和含有溴化域的表觀遺傳“閱讀器”，SP140功能缺失突變與克羅恩病相關。在2022年?項研究中，證明了SP140的存在會抑制健康細胞中的拓撲異構酶活性從而減少TOP與染色質的結合。而SP140的缺失導致TOP活性釋放，最終導致了巨噬細胞基因表達和對細菌的殺傷作?缺陷，從而造成了腸道的異常。文章還強調了突變位點可能是潛在治療靶點。

參考文獻：

Amatullah H, Fraschilla I, Digumarthi S, et al. Epigenetic reader SP140 loss of function drives Crohn's disease due to uncontrolled macrophage topoisomerases.Cell.2022;185(17):3232-3247.e18.doi:10.1016/j.cell.2022.06.048