長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)指的是長度超過200nt的RNA分子。它們不編碼蛋白，位于細胞核或胞質內，具有保守的二級結構，可與蛋白質、DNA和RNA相互作用，通過多種機制（如基因印記、染色質重塑、細胞周期調控、剪接調控、mRNA降解和翻譯調控等）在多種層面上（如表觀遺傳學、轉錄調控及轉錄后調控等）調控基因的表達水平。

    lncRNA參與多種生物學過程的調控，在多種生命活動中發(fā)揮重要作用，該領域的關注度也日益增高，已成為繼信使RNA(mRNA)、小RNA(microRNA、siRNA等)之后功能基因組學最火熱的研究領域。

服務內容

1、確定lncRNA表達

    利用q-PCR技術檢測lncRNA在不同組織中的表達水平。

2、探究lncRNA特點

  （1）通過QD-FISH原位雜交技術定位；或者通過細胞核質分離試劑盒得到RNA，qRT-PCR檢測其分布；

  （2）全長序列試驗方法：通過RACE得到lncRNA完整的全長序列。

3、lncRNA的功能研究

    lncRNA較長，承載的信息量多，更容易形成高級結構，其功能具有多樣化和特異性強的特點。類似于miRNA，探討lncRNA功能可用 gain/loss of function 策略，過表達或沉默lncRNA后觀察表型。即研究lncRNA功能獲得后或者功能缺失后對細胞增殖、凋亡、侵襲、轉移與克隆形成，以及病毒的轉錄復制等的影響。

    （1）功能獲得性研究

        構建lncRNA過表達質粒或者慢病毒、腺病毒包裝載體。

    （2）功能缺失性研究

        siRNA、shRNA、CRISPR/cas9。

4、檢測結合蛋白質

    利用體外轉錄，RNA pull down, MS等技術手段檢測與RNA綁定的蛋白質。

5、預測并驗證作用的miRNA

    利用軟件預測miRNA在lncRNA的作用靶點，并進行驗證。

6、表達調控

    將lncRNA表達與其他領域相結合，解釋其調控機理。（1）DNA甲基化和乙酰化：可通過檢測相應基因甲基化、乙酰化差異與lncRNA結合分析。（2）轉錄因子：研究lncRNA與轉錄因子的調控機制。