首頁集團(tuán)概況技術(shù)專題

看文章和做實(shí)驗(yàn)怎么選擇

信息來源：金開瑞作者：genecreate 發(fā)布時間：2017-12-13 17:05:10

我們在設(shè)計(jì)課題、寫標(biāo)書的時候，常常遇到這樣的問題：找到了一個新的分子，這個分子是在疾病組（或者實(shí)驗(yàn)組）高表達(dá)，而且通過細(xì)胞和動物實(shí)驗(yàn)證明了它的功能，在做機(jī)制的時候常遇到的問題是：為什么這個分子是高（低）表達(dá)的？也就是該分子表達(dá)異常的上游機(jī)制。

關(guān)于這一點(diǎn)，我們在前面以lncRNA為例介紹了很多機(jī)制，總體來說可以分為轉(zhuǎn)錄水平、轉(zhuǎn)錄后水平，甚至是蛋白翻譯水平（這一點(diǎn)包括在轉(zhuǎn)錄后水平），這是整個框架，大家在考慮的時候一定要有這種整體概念，不要被局部的研究主題（比如microRNA）所限制，否則一旦一個主題做不出來，就很容易遇到困境，本來科研就有風(fēng)險，一條路走不通我們可以考慮其他的路，不要在一棵樹上吊死，條條大路通課題嘛！

展開來說，組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子、DNA的甲基化修飾、基因的拷貝數(shù)變異等等，這些都是影響分子表達(dá)的轉(zhuǎn)錄水平的因素；可變剪接、RNA降解（比如microRNA介導(dǎo)）、RNA翻譯等等這些是在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生的RNA水平的影響分子表達(dá)的因素；當(dāng)?shù)鞍妆环g出來以后，蛋白會被修飾（比如磷酸化）從而影響活性，被折疊（如果折疊異常，蛋白不能形成正常的構(gòu)象，也會影響到功能），當(dāng)然，按照我們前面對分子機(jī)制的歸類，活性和表達(dá)分屬不同機(jī)制，還有就是蛋白的降解，比如我們以前說過的蛋白的泛素化途徑降解；

因此，理論上說，當(dāng)我們在研究蛋白異常表達(dá)的機(jī)制時，我們需要考慮這么多因素，比如我們首先需要對這么多因素進(jìn)行檢測，比如在10個可能性里面有三個可能性（比如蛋白的低表達(dá)可能同時由于基因被轉(zhuǎn)錄因子抑制、microRNA抑制mRNA翻譯和蛋白被泛素化降解所導(dǎo)致的），那么我們選擇一個方向或者幾個方向做就可以了，當(dāng)然，如果我們可以多做幾個，研究發(fā)表的文章分?jǐn)?shù)會更高，比如我們介紹過的一篇nature（（文章篇）S5E23: 研究microRNA發(fā)Nature的策略及延伸），對microRNA分子let7的異常低表達(dá)就是做出了三個因素；對課題申請來說，一個面上項(xiàng)目要求的復(fù)雜性也可以通過這種多因素來解決。

當(dāng)然，除了上游的分子機(jī)制外，下游的機(jī)制也可以同樣這么來思考，換個位置而已。

說了這么些，主要想說的意思是，大家在做課題的時候一定要有這種理論支撐，盡量能從全局的角度來考慮課題。做實(shí)驗(yàn)很重要，看文章也同樣重要，文章看好了真的是能少走很多彎路，也經(jīng)常有新的思路出來。

上一條：FISH探針標(biāo)記方法大全

下一條：研究蛋白-蛋白互作方法—親和純化結(jié)合SWATH（AP-SWATH）

最新動態(tài)