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亞細胞蛋白質組學

信息來源:金開瑞 作者:genecreate 發布時間:2019-05-10 14:01:22

       亞細胞蛋白質組學(subcellular proteomics)是針對細胞內不同區域結構功能單位的蛋白質組學研究,可以減少全細胞蛋白組分析的復雜性。對亞細胞結構進行功能分析,將定量技術和差異分析引入亞細胞蛋白質組學,來觀察亞細胞結構的蛋白質組在某些生理或病理條件下的變化,可加深對細胞生理分子機制和亞細胞組分結構功能的理解。
       武漢金開瑞結合多年蛋白組學研究經驗,已成功實現對多個亞細胞器組分的定性和定量分析,包括膜蛋白質組、葉綠體蛋白質組、線粒體蛋白質組等。
 
膜蛋白質組
  • 膜蛋白質組
真核生物中,細胞質膜 (plasma membrane) 與細胞內膜統稱為生物膜 。生物膜最基本的作用是維持細胞內微環境的相對穩定,并與外界環境不斷地進行物質交換、能量和信息的傳遞。與細胞起源、細胞分裂分化、細胞識別免疫、物質運輸、信息傳遞、代謝調控、能量轉換神經傳導以及腫瘤的發生均有關。
膜蛋白的功能異常與多種疾病直接相關,其中50%是目前已知藥物的作用靶點。膜蛋白質組學研究可用于尋找疾病標志物,篩選藥物作用靶點等。
  • 葉綠體蛋白質組
葉綠體是植物和綠藻的特征細胞器,是植物進行光合作用的主要場所,是除細胞核外存在遺傳物質的細胞器之一。據估計高等植物共有約21000-25000個蛋白質,其中葉綠體的蛋白質占10%-20%。
利用蛋白組學技術全面了解植物葉綠體的生物發生、結構功能及其對不同環境的光合響應調節機制,明確葉綠體不同膜區和膜間隔微區定位的亞蛋白質組信息,將有望在揭示植物葉綠體適應環境變化的調節機制以及闡明葉綠體在植物生長發育及代謝調控等生命活動中的規律等方面有新突破。
  • 線粒體蛋白質組
線粒體是細胞能量代謝、生物合成和細胞死亡的調控中心,其蛋白結構和功能的改變會導致許多疾病的產生。線粒體蛋白質組學研究可為解析線粒體的生理功能、探索線粒體相關疾病的發病機制及促進線粒體為靶向的藥物研發提供重要理論依據。
線粒體是真核細胞重要的細胞器,是細胞能量代謝、生物合成和細胞死亡的調控中心,其蛋白結構和功能的改變會導致許多疾病的產生,如神經退行性疾病、癌癥、心臟病和糖尿病等。
線粒體蛋白質組學旨在從整體角度出發,分析線粒體的蛋白質組成、表達水平與修飾狀態等的動態變化,闡明線粒體內全部蛋白質的表達模式和功能模式,以及蛋白質相互作用等,為解析線粒體的生理功能、探索線粒體相關疾病的發病機制及促進線粒體為靶向的藥物研發提供重要理論依據。
 
技術流程:

技術流程
   
我們的技術優勢:
高穩定蛋白提取方法:在主流提取(膜蛋白/線粒體/葉綠體/外泌體等)技術的基礎上,優化了提取方案的上下游,使提取純度在原有基礎上增加10-20%,蛋白通量增加15%
高性能質譜系統:配備高性能質譜系統和SWATH全掃描采集方式,有效提升了對極低豐度的亞細胞相關蛋白的鑒定
多數據庫整合:通過整合多個相關的高質量蛋白數據庫,極大提高亞細胞蛋白定位準確度和通量
多維度數據分析:鑒定蛋白除了與更全的相關亞細胞數據庫比較外,同時基于計算方法,使用多款軟件進行亞細胞定位預測分析,進一步增加鑒定通量。
 
近期活動:
 




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