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EMSA電泳遷移率實(shí)驗(yàn)

信息來(lái)源:金開(kāi)瑞 作者:genecreate 發(fā)布時(shí)間:2022-12-05 10:51:33

一、凝膠遷移或電泳遷移率實(shí)驗(yàn)介紹

凝膠遷移或電泳遷移率實(shí)驗(yàn)(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)是一種研究蛋白質(zhì)和DNA序列相互結(jié)合的技術(shù),可用于定性或定量分析。

 

二、EMSA原理簡(jiǎn)介

蛋白質(zhì)可以與生物素標(biāo)記的核酸探針結(jié)合,電泳時(shí)這種復(fù)合物比無(wú)蛋白結(jié)合的探針在凝膠中泳動(dòng)的速度慢,即表現(xiàn)為相對(duì)滯后。

目的蛋白與生物素標(biāo)記的DNA探針結(jié)合,電泳時(shí)蛋白-DNA復(fù)合物比無(wú)蛋白結(jié)合的DNA探針在凝膠中泳動(dòng)的速度慢,顯影出現(xiàn)相對(duì)滯后條帶。

 

三、EMSA類(lèi)型
 
1、驗(yàn)證型EMSA

用于驗(yàn)證探針是否含有可與蛋白質(zhì)結(jié)合的位點(diǎn)。將結(jié)合位點(diǎn)突變,以突變探針為對(duì)照,野生型探針出現(xiàn)遷移條帶,而突變探針未出現(xiàn)遷移條帶,則說(shuō)明該探針含有可與蛋白質(zhì)結(jié)合的位點(diǎn)。

2、競(jìng)爭(zhēng)型EMSA

探針序列不變,不含修飾基團(tuán)的探針?lè)Q為冷探針。冷探針與標(biāo)記探針競(jìng)爭(zhēng)性地與蛋白結(jié)合,冷探針不顯影出遷移條帶。以冷探針為對(duì)照,標(biāo)記探針出現(xiàn)遷移條帶,而冷探針遷移條帶減弱或消失,則排除了假陽(yáng)性干擾,增加實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性。

3、超遷移EMSA

使用目標(biāo)蛋白的特異性抗體,蛋白-探針復(fù)合物被抗體識(shí)別并結(jié)合,該三聚復(fù)合物在凝膠電泳中,遷移速率再次增大,出現(xiàn)在蛋白-探針復(fù)合物的上方的超遷移條帶,驗(yàn)證了探針與目的蛋白的特異性結(jié)合。

 

四、電泳遷移率實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)

● 亦可用于研究RNA結(jié)合蛋白和其相關(guān)RNA序列的相互作用。

● 如需要做超遷移,需提供IP級(jí)別的抗體。

● EMSA與酵母單雜交,可共同驗(yàn)證同一個(gè)問(wèn)題。

 

五、項(xiàng)目流程
 

 

六、報(bào)價(jià)與周期

● 提取總蛋白

項(xiàng)目 數(shù)量 單價(jià) 總價(jià) 周期
蛋白提取與WB驗(yàn)證 1 300 300 5
DNA探針合成(<60bp) 1 450 420 12
EMSA 1 4500 4200 20
報(bào)價(jià) 5250 37
優(yōu)惠價(jià) 3675 37

● 蛋白表達(dá)與純化

項(xiàng)目 數(shù)量 單價(jià) 總價(jià) 周期
基因合成 n 0.8 0.8*n 15
載體構(gòu)建與足量提取 1 800 800 5
小量表達(dá) 1 800 800 10
大量表達(dá)及純化 1 4000 4000 18
DNA探針合成(<60bp) 1 450 450 12
EMSA 1 4500 4500 20
報(bào)價(jià) 10550+0.8*n 68
優(yōu)惠價(jià) 6875+0.8*n 68

 

文獻(xiàn)分享

Nuclear factor kappa B/p65 plays a positive role in peroxisome proliferator-activated receptor δ expression in orange-spotted grouper , Epinephelus coioides.

期刊:Fish and Shellfish Immunology   IF:3.298   發(fā)表時(shí)間:2020

Binding reactions of Ecp65 and EcPPARδ promoter. Biotin-labelled EMSA probes are incubated with lysates of HEK293T cells including Ecp65 protein. WT, wild-type probe; MT, mutated probe. Positive control indicates EcPPARδ+Protein, negative control indicates EcPPARδ-WT.

文章中EMSA實(shí)驗(yàn)由本公司提供相關(guān)服務(wù)。

Functional Analysis of IRF1 Reveals its Role in the Activation of the Type I IFN Pathway in Golden Pompano, Trachinotus ovatus (Linnaeus 1758).

期刊:Int J Mol Sci.   IF:4.183   發(fā)表時(shí)間:2020

Binding reactions of IRF1 and ToIFNa3 prompter. Biotin-labeled EMSA probes were incubated with lysates of HEK293T cells containing ToIRF1 protein.WT,wild-type probe;MT:mutated probe.1,negative control;2,positive control;3,plus ToIFNa3-P2-WT5;4,ToIFNa3-P2-WT5 plus ToIRF1-Flag;5,plus ToIFNa3-P2-MT5;6,ToIFNa3-P2-MT5 plusToIRF1-Flag.

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