知無不“研”|5篇高分文獻帶你一覽高通量酵母雜交的非凡魅力~
酵母轉錄因子Gal4包含DNA結合結構域(Gal4-BD)和轉錄激活域(Gal4-AD),誘餌(prey)與Gal4-BD融合,獵物(bait)蛋白與Gal4-AD融合,當誘餌和獵物發?相互作用時,Gal4-BD和Gal4-AD在空間上充分接近,可呈現完整的GAL4轉錄因子活性,啟動激活報告基因AUR1-C、ADE2、HIS3和MEL1的轉錄。
高通量酵母雜交技術,作為酵母雙雜交技術與高通量技術的融合,已經在生物科學研究中發揮了重要的作用。研究者可以在相對短的時間內,對數以萬計的蛋白質對進行大規模的篩選和鑒定,從而得到豐富的蛋白質相互作用圖譜。至今,科研人員已經運用這項技術發表了許多高水平文章,其中不乏許多經典的高分文獻,我們一起來看看~
01 Nature:人類蛋白質二元互作組參考圖譜——HuRI誕生!
這篇文章由來自Dana-Farber癌癥研究所、哈佛大學醫學院、多倫多大學等多家單位超80名研究人員,跨越了近十年的努力,共同合作完成。該研究通過約30億次酵母雙雜交實驗檢測了人體內53,000余種二元蛋白相互作用,涉及超過8,000種蛋白質,并成功繪制迄今為止最大規模的人類蛋白質互作組圖譜(human binary protein interactome, HuRI)。
(圖源:10.1038/s41586-020-2188-x)
02 Nat Cell Biol:一種綜合的秀麗隱桿線蟲細胞極性蛋白之間的二元相互作用和表型圖譜
細胞極性的建立是多細胞生物發育以及細胞和組織功能發揮所必需的基本過程。本研究使用酵母雙雜交技術,結合表型分析,構建了一個關于秀麗隱桿蟲細胞極性建立和維持的蛋白質相互作用網絡。該網絡提供了大量候選相互作用,有助于進一步深入了解細胞極性的機制。
圖1C用于建立秀麗隱桿線蟲細胞極性相互作用網絡的酵母雙雜交篩選和計算驗證流程概述
(圖源:doi:10.1038/ncb3300)
03 Nature Biotechnology:一種SARS-cov-2病毒與人源蛋白之間的綜合互作網絡揭示COVID-19的病理生物學和潛在宿主治療靶點
研究病毒與宿主之間的蛋白質-蛋白質相互作用有助于發現治療病毒感染的方法。本研究利用酵母雙雜交和質譜技術,構建了SARS-CoV-2與宿主的蛋白質互作網絡,發現了新的病毒與宿主互作關系,并通過藥物篩選確定了可能對COVID-19有治療作用的候選藥物。這些發現有助于深入了解病毒與宿主相互作用機制,并為藥物研發提供了新方向。
(圖源:https://doi.org/10.1038/s41587-022-01474-0)
04 Nature Communications:黑腹果蠅下一代大規模二元蛋白相互作用網絡
研究團隊通過酵母雙雜交技術,構建了涵蓋數千種蛋白質相互作用的果蠅蛋白相互作用網絡。這個網絡有助于識別新的生物學路徑和過程組件,并為研究蛋白質功能和疾病建模提供了寶貴的數據資源。特別是對自噬網絡的研究揭示了deformed wings(dwg)基因編碼蛋白的雙重角色,為理解蛋白質網絡和功能提供了新的視角。
圖1A系統篩選流程的示意圖
(圖源:https://doi.org/10.1038/s41467-023-37876-0)
05 Nature Communications:柑橘黃龍病病原體CLas的蛋白質互作網絡
該文章對柑橘黃龍病病原體CLas的蛋白質相互作用的研究進行了描述。通過使用酵母雙雜交系統,作者確定了CLas中542個蛋白質之間共計4245個相互作用關系,從而揭示了其潛在功能。這些發現為理解CLas的生物學和致病機制提供了新的見解,并為進一步的研究提供了寶貴的資源。
(圖源:https://doi.org/10.1038/s41467-023-43648-7)
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參考文獻:
doi:10.1038/ncb3300.
https://doi.org/10.1038/s41587-022-01474-0
https://doi.org/10.1038/s41467-023-37876-0
https://doi.org/10.1038/s41467-023-43648-7
doi:10.1038/s41586-020-2188-x
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