磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)常見(jiàn)問(wèn)題解答
信息來(lái)源：金開(kāi)瑞 作者：genecreate 發(fā)布時(shí)間：2018-10-25 14:25:42
1. 蛋白質(zhì)磷酸化發(fā)揮作用的途徑：（信號(hào)傳導(dǎo)）
2. 真核細(xì)胞蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)一般位于（絲氨酸）、（蘇氨酸）、（賴氨酸）
3. 蛋白激酶在細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑主要作用：（調(diào)節(jié)細(xì)胞活性）、（放大傳導(dǎo)信號(hào)）
4. 目前常用的磷酸肽富集方式（TiO2）、（IMAC）
5. 磷酸化蛋白組定性分析包括（單一磷酸化位點(diǎn)鑒定）、（全譜鑒定）
6. 磷酸化蛋白組定量分析包括（iTRAQ）、（label free）、（SWATH）
7. 磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)一般要求蛋白起始量達(dá)到（3mg）
8. 我公司使用的磷酸化富集方法是（Fe-IMAC）
9. 磷酸化鑒定數(shù)目多少的最大影響因素是（樣品本身的磷酸化水平）
10. 磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)信息分析包括經(jīng)典分析和高級(jí)分析，請(qǐng)問(wèn)分別是哪些？
（1）經(jīng)典分析包括：修飾蛋白、修飾位點(diǎn)鑒定；鑒定結(jié)果特征分布：肽段長(zhǎng)度、蛋白覆蓋度分布、unique肽段分布；修飾位點(diǎn)motif預(yù)測(cè)；蛋白質(zhì)GO功能分類、COG注釋、Pathway通路注釋；
（2）高級(jí)分析包括：蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)互作預(yù)測(cè)；蛋白質(zhì)Domain預(yù)測(cè)；磷酸化蛋白激酶預(yù)測(cè)。
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